Edisi pertama ISL menggunakan format yang sama untuk pemain asing sebagai edisi sebelumnya liga lapisan atas di Indonesia, yang membolehkan kelab untuk mempunyai 5 pemain asing dari mana-mana negara (hanya 3 boleh bermain dalam satu perlawanan).

Walau bagaimanapun, bermula edisi 2009-10, PSSI menggunakan format baru, yang dikenali sebagai format "3 + 2", di mana sekurang-kurangnya 2 daripada 5 pemain asing dalam setiap kelab adalah dari negara-negara Asia. Tambahan pula, mereka pemain import perlu mematuhi syarat yang berikut[2]:

• Pemain dari negara-negara Eropah atau Amerika sepatutnya bermain dalam Divisyen kedua (sistem pertandingan masing-masing lapisan ketiga).
• Pemain dari negara-negara Afrika sepatutnya bermain dalam (sekurang-kurangnya) dalam Divisyen pertama (sistem pertandingan masing-masing lapisan kedua).
• Pemain-pemain dari negara-negara Asia perlu memainkan (sekurang-kurangnya) dalam liga perdana/super (sistem pertandingan masing-masing lapisan tertinggi).
• Pemain dari negara-negara Asia Tenggara perlu berada dalam pasukan kebangsaan mereka.

Pada edisi 2010-2011, PSSI memperkenalkan peraturan baru mengenai pendaftaran pemain import baru dari negara-negara Afrika. Pemain dari negara-negara Afrika yang tidak pernah bermain sebelum ini di Liga Super Indonesia akan menjadi pemain antarabangsa untuk negaranya. Para pemain masing-masing perlu menunjukkan bukti-bukti rasmi bahawa mereka telah bermain untuk negara mereka di perlawanan rasmi FIFA. Pemain-pemain gagal menunjukkan bukti-bukti itu tidak akan mendapat kebenaran untuk bermain di Liga Super Indonesia 2010-2011.[3]